Županijski stožer je stručno operativno tijelo, ovlašteno za vršenje poslova koji su  mu Zakonom o zaštiti i spašavanju ljudi i materijalnih dobara od prirodnih i drugih nesreća i Zakonom o nadležnostima županijskih tijela vlasti Hercegovačko-neretvanske županije u oblasti zaštite i spašavanja ljudi i materijalnih dobara od prirodnih i drugih nesreća, stavljeni u ovlast.
U vršenju poslova iz svoje ovlasti Županijski stožer funkcionira stalno, kad Vlada HNŽ proglasi nastanak prirodne ili druge nesreće u Županiji, a u razdoblju kada ne postoje prirodne ili druge nesreće, Županijski stožer svoje funkcije ostvaruje povremeno, prema potrebi i to onda kada razmatra stanje priprema, organiziranosti, opremljenosti i osposobljenosti za zaštitu i spašavanje svih nositelja zaštite i spašavanja na području Županije i predlaže mjere za dogradnju sustava zaštite i spašavanja i kada djeluje preventivno u cilju sprečavanja nastajanja prirodne ili druge nesreće i sudjeluje u vježbama i drugim vidovima obučavanja i osposobljavanja.

Županijski stožer čine zapovjednik, načelnik i članovi.

Zapovjednik Županijskog stožera je po položaju jedan od članova Vlade Hercegovačko-neretvanske županije ( u daljnjem tekstu: Vlada Županije).

Ravnatelj Županijske uprave za civilnu zaštitu i vatrogastvo ( u daljem tekstu: Županijska uprava), po položaju je načelnik Županijskog stožera.

Tajnik Crvenog križa Hercegovačko-neretvanske županije i državni službenik za informiranje iz Ureda predsjednika Vlade  Županije, po funkciji su članovi Županijskog stožera.

Članovi Županijskog stožera iz županijskih ministarstava i Županijske uprave su:
1)    rukovodeći državni službenik Županijskog ministarstva unutarnjih poslova,
2)    rukovodeći državni službenik u Županijskom ministarstvu zdravstva, rad i socijalne skrbi,
3)    rukovodeći državni službenik u Županijskom ministarstvu prometa i veza,
4)    rukovodeći državni službenik u Županijskom ministarstvu trgovine, turizma i zaštite okoliša,
5)    rukovodeći državni službenik u Županijskom ministarstvu poljoprivrede, šumarstva i vodoprivrede,
6)    rukovodeći državni službenik u Županijskom ministarstvu graditeljstva i prostornog uređenja,
7)    rukovodeći državni službenik u Županijskom ministarstvu gospodarstva,
Do tri člana Županijskog stožera određuje ravnatelj Županijske uprave za civilnu zaštitu i vatrogastvo iz reda državnih službenika koji izravno obavljaju poslove vezane za mjere zaštite i spašavanja.
 

Zapovjednika, načelnika i članove Županijskog stožera postavlja i razrješava Vlada Županije, na prijedlog ravnatelja Županijske uprave.